Білки

Амінокислоти - Структурні компоненти белков.Белкі, або протеїни (грец. protos -- першорядний), - це біологічні гетерополімери, мономерами яких є амінокислоти.

Амінокислоти являють собою низькомолекулярні органічні сполуки, що містять карбоксильних (-СООН) і Амін (-NH2) групи, які пов'язані з одним і тим же атомом вуглецю. До атому вуглецю приєднується бічний ланцюг - який-небудь радикал, що надає кожній амінокислоті певні властивості. Загальна формула амінокислот має вигляд:

У здебільшого амінокислот є одна Карбоксильна група і один аміногрупи; ці амінокислоти називаються нейтральними. Існують, однак, і основні амінокислоти - з більш ніж однієї аміногрупи, а також кислі амінокислоти - з більш ніж однієї карбоксильної групою.

Відомо близько 200 амінокислот, що зустрічаються в живих організмах, проте лише 20 з них входять до складу білків. Це так звані основні, або белокобразующіе (протеіногенние), амінокислоти.

В Залежно від виду радикала основні амінокислоти ділять на три групи: 1) неполярні (аланін, метіонін, валін, про-лин, лейцин, ізолейцин, триптофан, фенілаланін); 2) полярні незаряджені (аспарагін, глутамін, серії, гліцин, тирозин, треонін, цистеїн); 3) полярні заряджені (аргінін, гістидин, лізин -- позитивно; аспарагінова і глутамінова кислоти - негативно).

Бічні ланцюги амінокислот (радикал) можуть бути гідрофобними або гідрофільними, що надає білків відповідні властивості, які проявляються при утворенні вторинної, третинної і четвертинної структур білка.

У рослин всі необхідні амінокислоти синтезуються з первинних продуктів фотосинтезу. Людина і тварини не здатні синтезувати ряд протеіногенних амінокислот і повинні отримувати їх у готовому вигляді разом з їжею. Такі амінокислоти називаються незамінними. До них відносяться лізин, валін, лейцин, ізолейцин, треонін, фенілаланін, триптофан, метіонін; атакож аргінін і гістидин - Незамінні для дітей,

В розчині амінокислоти можуть виступати в ролі як кислот, так і підстав, тобто вони є амфотерним сполуками. Карбоксильна група-СООН здатна віддавати протон, функціонуючи як кислота, а аміни - NH2 - приймати протон, виявляючи таким чином властивості підстави.

Пептиди. Аміногрупи однієї амінокислоти здатна вступати в реакцію з карбоксильної групою іншої амінокислоти.

що утвориться при цьому молекула є дипептид, а зв'язок-CO-NH-називається пептидного зв'язком:

На одному кінці молекули дипептид знаходиться вільна аміногрупи, а на іншому -- вільна Карбоксильна група. Завдяки цьому дипептид може приєднувати до собі інші амінокислоти, утворюючи олігопептиди. Якщо таким чином з'єднується багато амінокислот (понад десять), то виходить поліпептид.

Пептиди грають важливу роль в організмі. Багато оліго-і поліпептиди є гормонами, антибіотиками, токсинами.

До олігопептиди відносяться окситоцин, вазопресин, тиреотропін, а також брадикінін (пептид болю) і деякі опіати ( «природні наркотики» людини), виконують функцію знеболювання. Прийняття наркотиків руйнує опіатних систему організму, тому наркоман без дози наркотиків відчуває сильний біль - «Ломку», яка в нормі знімається опіатами. До олігопептиди відносяться і деякі антибіотики (наприклад, граміцидин S).

Багато гормони (інсулін, адренокортикотропний гормон та ін,), антибіотики (наприклад, граміцидин А), токсини (наприклад, дифтерійний токсин) є поліпептидами.

Білки являють собою поліпептиди, в молекулу яких входить від п'ятдесяти до декількох тисяч амінокислот з відносною молекулярною масою понад 10 000.

Структура білків. Кожному білку в певному середовищі властива особлива просторова структура. При характеристиці просторової (тривимірної) структури виділяють чотири рівні організації молекул білків (рис. 1,1).        

ЛІЕ-гли-тре-ала-ала-ала-ліз-фен-гли-АРГ-Глн-гіc-мет-асп-сер-   

сер-тре-сер-ала-ала-сер-сер-сер-АСН-тир-цис-АСН-гли-мет-мет-   

ліз-сер-АРГ-АСН-лей-тре-ліз-асп-АРГ-цис-ліз-про-вал-АСН-тре-   

фен - вал-гіс-гли-сер-лей-ала-асп-вал-Глн-ала-вал-цис-сер-Глн-   

ліз-АСН-вал-ала-цис-ліз-АСН-гли-Глн-тре-АСН-цис-три-Глн-сер-   

три-сер-тре-мет-сер-мулі-тре-асп-цис-АРГ-гли-тре-гли-сер-сер-   

ЛІЕ-тир-про-АСН-цис-ала-тир-ЛІЕ-тре-тре-Глн-ала-АСН-ліз-гіс-   

мулі-мулі-вал-ала-цис-гли-гли-АСН-про-тир-вал-про-вал-гіс-фен-   

асп-ала-сер-вал     

Рис. 1.1. Рівні структурної організації білків: а - первинна структура -- амінокислотна послідовність белкарібонуклеази (124 амінокислотних ланки); б - вторинна структура - пояіпептідная ланцюг закручена у вигляді спіралі; в -- третинна структура білка міоглобіну; г - четвертинна структура гемоглобіну.

Первинна структура - послідовність амінокислот у поліпептидного ланцюга. Така структура специфічна для кожного білка і визначається генетичною інформацією, тобто залежить від послідовності нуклеотидів в ділянці молекули ДНК, кодує даний білок. Від первинної структури залежать усі властивості та функції білків. Заміна одного-єдиного амінокислоти у складі молекул білка або порушення порядку в їх розташуванні зазвичай тягне за собою зміну функції білка.

огляду на те, що до складу білків входить 20 видів амінокислот, число варіантів їх комбінацій в поліпептидного ланцюга воістину безмежний, що забезпечує величезну кількість видів білків в живих клітинах. Наприклад, в організмі людини виявлено більше 10 тис. різних білків, і всі вони побудовані з одних і тих же 20 основних амінокислот.

В живих клітинах молекули білків або окремі їх ділянки являють собою не витягнуту ланцюг, а скручені в спіраль, що нагадує розтягнуту пружину (це так звана а-спіраль), або складені в складчастий шар (р-шар). Такі а-спіралі і р-шари є вторинною структурою. Вона виникає в результаті утворення водневих зв'язків всередині однієї поліпептидного ланцюга (галактика конфігурація) або між двома поліпептидними ланцюгами (складчасті шари).

Повністю a-спіральну конфігурацію має білок кератин. Це структурний білок волосся, нігтів, кігтів, дзьоба, пір'я і рогів; він входить до складу зовнішнього шару шкіри хребетних.

У більшості білків спіральні й неспіральние ділянки поліпептидного ланцюга складаються в тривимірне освіта кулястої форми - глобул (характерна для глобулярних білків). Глобул певної конфігурації є третинної структурою білка. Така структура стабілізується іонними, водневими, ковалентними дисульфідними зв'язками (утворюються між атомами сірки, що входять до склад цист-ну, цистину і мегіоніна), а також гідрофобними взаємодіями. Найбільш важливими у виникненні третинної структури є гідрофобні взаємодії; білок при цьому згортається таким чином, що його гідрофобні бічні ланцюги приховані усередині молекули, тобто захищені від зіткнення з водою, а гідрофільні бічні ланцюги, навпаки, виставлені назовні.

Багато білки з особливо складною будовою складаються з декількох поліпептидних ланцюгів (субодиниць), утворюючи четвертинних структуру білкової молекули. Така структура є, наприклад, у глобулярні білка гемоглобіну. Його молекула складається з чотирьох окремих поліпептидних субодиниць (протомеров), що знаходяться в третинної структурі, і небілкової частини - гема.

Тільки в такій структурі гемоглобін здатний виконувати свою транспортну функцію.

Під впливом різних хімічних та фізичних факторів (обробка спиртом, ацетоном, кислотами, лугами, високою температурою, опроміненням, високим тиском і т. д.) відбувається зміна вторинної, третинної і четвертинної структур білка внаслідок розриву водневих і іонних зв'язків. Процес порушення нативної (природного) структури білка називається денатурацією. При цьому спостерігається зменшення розчинності білка, зміна форми і розмірів молекул, втрата ферментативної активності і т. д. Процес денатурації може бути повним або частковим. У деяких випадках перехід до нормальних умов середовища супроводжується самовільним відновленням природної структури білка. Такий процес називається ренатурації.

Прості і складні білки. За хімічним складом виділяють білки прості і складні. До простьм відносяться білки, що складаються тільки з амінокислот, а до складний - білки, містять білкову частину і небілкової (простетичної); простетичної групу можуть утворювати іони металів, залишок фосфорної кислоти, вуглеводи, ліпіди і ін Простими білками є сироватковий альбумін крові, фібрин, деякі ферменти (трипсин) та ін До складних білок відносяться всі протеоліпіди і глікопротеїни; складними білками є, наприклад, імуноглобуліни (антитіла), гемоглобін, більшість ферментів і т. д.

Опції білків.

Структурна. Білки входять до складу клітинних мембран і матриксу органел клітини. Стінки кровоносних судин, хрящі, сухожилля, волосся, нігті, кігті у вищих тварин складаються переважно з білків.

Каталітична (ферментативна). Білки-ферменти каталізують протікання всіх хімічних реакцій в організмі. Вони забезпечують розщеплення поживних речовин в травному тракті, фіксацію вуглецю при фотосинтезі і т. д.

Транспортна. Деякі білки здатні приєднувати і переносити різні речовини. Альбуміни крові транспортують жирні кислоти, глобуліни - іони металів і гормони, гемоглобін - кисень і вуглекислий газ. Молекули білків, що входять до складу плазматичної мембрани, беруть участь у транспортуванні речовин в клітку.

Защитная. Її виконують імуноглобуліни (антитіла) крові, що забезпечують імунний захист організму. Фібриноген і тромбін беруть участь у згортання крові та запобігають кровотеча.

скорочувальна. Завдяки ковзання щодо один одного Актинові і міозінових протофібрілл відбувається скорочення м'язів, а також немишечние внутрішньоклітинні скорочення. Рух вій і джгутиків пов'язано з ковзанням щодо один одного мікротрубочок, які мають білкову природу.

Регуляторна. Багато гормонів є олігопептиди або бедкамі (наприклад, інсулін, глюкагон [антагоніст інсуліну], адренокортикотропний гормон та ін.)

рецепторних. Деякі білки, вбудовані в клітинну мембрану, здатні змінювати свою структуру під впливом зовнішнього середовища. Так відбувається прийом сигналів ззовні і передача інформації в клітку. Прикладом може служити фіто-хром - світлочутливий білок, що регулює фотоперіодичних реакцію рослин, і опсін - складова частина родопсину, пігменту, що знаходиться в клітинах сітківки ока.

Енергетична. Білки можуть служити джерелом енергії в клітині (після їх гідролізу). Зазвичай білки витрачаються на енергетичні потреби в крайніх випадках, коли вичерпані запаси вуглеводів і жирів.

Ферменти (ензими). Це специфічні білки, які присутні у всіх живих організмах і відіграють роль біологічних каталізаторів.

Хімічні реакції в живій клітині протікають при певній температурі, нормальному тиску і відповідної кислотності середовища. У таких умовах реакції синтезу або розпаду речовин протікали б в клітці дуже повільно, якщо б вони не піддавалися впливу ферментів. Ферменти прискорюють реакцію без зміни її загального результату за рахунок зниження енергії активації, тобто при їх присутності потрібно значно менше енергії для додання реакційної здатності молекул, які вступають в реакцію, або реакція йде іншим шляхом з меншим енергетичним бар'єром.

Всі процеси в живому організмі прямо або опосередковано здійснюються за участю ферментів. Наприклад, під їх дією складові компоненти їжі (білки, вуглеводи, ліпіди та ін) розщеплюються до більш простих з'єднань, а з них вже потім синтезуються нові, властиві даному виду макромолекули. Тому порушення утворення і активності ферментів нерідко призводять до виникнення важких хвороб.

За просторової організації ферменти складаються з декількох підлогу і пептидних ланцюгів і зазвичай мають четвертинної структурою. Крім того, ферменти можуть включати і небілкових структури. Білкова частина носить назву апофермент, а небілкової - кофактор (якщо це катіони чи аніони неорганічних речовин, наприклад, Zn2-Мп2 + і т. д.) або кофермент (коензим) (якщо це низькомолекулярні органічна речовина).

Попередниками або складовими частинами Багатьох Кофери-ментів є вітаміни. Так, пантотенова кислота - складова частина коензиму А, нікотинова кислота (вітамін РР) -- попередник НАД та НАДФ і т. д.

ферментативний каталіз підкоряється тим же законам, що й неферментативним каталіз в хімічній промисловості, проте на відміну від нього характеризується надзвичайно високою ступенем специфічності (фермент каталізує тільки одну реакцію або діє тільки на один тип зв'язку). Цим здатні утворювати органічні сполуки з неорганічних процесів (дихання, травлення, фотосинтез та ін), що протікають в клітині і організмі. Наприклад, фермент уреаза каталізує розщеплення лише одного речовини - сечовини (H2N-CO-NH2 + Н2 О -> - »2NH 3 + СО2), не надаючи каталітичної дії на структурно-родинні з'єднання.

Для розуміння механізму дії ферментів, що мають високу специфічність, дуже важлива теорія активного центру. Відповідно до неї, в молекулі кожного ферменту є одні ділянку або більше, в яких відбувається каталіз за рахунок тісної (у багатьох точках) контакту між молекулами ферменту і специфічної речовини (субстрату). Активним центром виступає як функціональна група (наприклад, ОН-група серину), або гетеротрофами. Звичайно ж для каталітичного дії необхідне поєднання декількох (в середньому від 3 до 12) розташованих в певному порядку амінокислотних залишків. Активний центр також формується пов'язаними з ферментом іонами металів, вітамінами та іншими сполуками небілкової природи - коферментом, або кофактором. Причому форма та хімічна будова активного центру такі, що з ним можуть зв'язуватися тільки певні субстрати в силу їх ідеального відповідності (взаємодоповнюваності або. комплементарності) один одному. Роль інших амінокислотних залишків у великої молекулі ферменту полягає в тому, щоб забезпечити його молекулі глобулярні відповідну форму, яка потрібна для ефективної роботи активного центру. Крім того, навколо великої молекули ферменту виникає сильне електричне поле. У такому полі стає можливою орієнтація молекул субстрату та придбання ними асиметричної форми. Це призводить до ослаблення хімічних зв'язків, і каталізується реакція відбувається з меншою початковій витратою енергії, а отже, з набагато більшою швидкістю. Наприклад, одна молекула ферменту каталази може розщепити за 1 хв більше 5 млн. молекул пероксиду водню (Н202), який виникає при окисленні в організмі різних сполук.

У деяких ферментів у присутності субстрату конфігурація активного центру зазнає змін, тобто фермент орієнтує свої функціональні групи таким чином, щоб забезпечити найбільшу каталітичну активність.

На заключному етапі хімічної реакції фермент-субстратної комплекс відокремлюється з утворенням кінцевих продуктів і вільного ферменту. Звільнився при цьому активний центр може приймати нові молекули субстрату.

Швидкість ферментативних реакцій залежить від багатьох факторів: природи і концентрації ферменту і субстрату, температури, тиску, кислотності середовища, наявності інгібіторів і т. д. Наприклад, при температурах, близьких до нуля, швидкість біохімічних реакцій сповільнюється до мінімуму. Ця властивість широко використовується в різних галузях народного господарства, особ-но в сільському господарстві та медицині. Зокрема, консервація різних органів (нирок, серця, селезінки, печінки) перед їх пересадкою хворому відбувається при охлажденита з метою зниження інтенсивності біохімічних реакцій і продовження часу життя органів. Швидке заморожування харчових продуктів запобігає ріст і розмноження мікроорганізмів (бактерій, грибів тощо), атакож інактивує їх травні ферменти, так що вони опиняються вже не в змозі викликати розкладання харчових продуктів.

Список літератури

Н.А. Лемеза Л. В. Камлюк Н.Д. Лисов "Посібник з біології для вступників до ВНЗ "

Щоб підготовки даної роботи були використані матеріали з сайту http://biology.asvu.ru